聖殿為此廟之主殿,主祀天上聖母,「鎮殿媽祖」及「天上聖母老太祖媽(開基媽)」為主要特色。 而番老太祖、柳將軍、金將軍皆為媽祖的護法,尤其以原住民出身的番老太祖,象徵原漢融合的歷史痕跡。 而神農大帝、童子相神農大帝、七星娘媽、虎將軍,為聖殿的旁祀神明。